Правилно е да се пише подотдел , мн.ч. подотдели . В тази дума под- е представка и винаги се пише по този начин.

В подотдел 284л имаше повалени дървета, чиито стволове бяха цели. В организацията се създаваха дирекции, отдели и подотдели , които се занимаваха с разрешаването на непрекъснато възникващите проблеми.